ホタルイカをまるごと、醤油に数時間〜数日漬け込んで食べます。
醤油に日本酒を加えて煮立てたものや、それに唐辛子、わさびを入れたものを漬け汁にする場合もあります。また出汁を加えることもあります。食べる直前にユズなどの柑橘類の香りをつけて臭みを和らげるという調理法も見られます。

ホタルイカを沖漬けにしたものは富山県の名物として広く知られています。